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八核+七卡!泡泡网DIY个人超级计算机

蛋白质折叠计算:七卡就是七倍性能!

    一般的商业CUDA软件都只能支持单GPU,而且无法利用高端显卡全部的性能,像Badaboom这样经过特别优化的软件也只能支持双GPU。虽然很多专业CUDA计算软件能支持N多GPU,但民用通用计算软件只有Folding@Home(蛋白质折叠计算)和SETI@home(天文数据外星文明分析)这两个分布式计算支持多GPU。

    Folding@home是一个由斯坦福大学主持,全球主要硬件厂商共同参与的大规模公益性分布式运算项目。其主要是研究了解蛋白质折叠、误折以及相关的疾病,主要研究的疾病包括:癌症、阿兹海默症、亨廷顿病、帕金森氏症等。我想,这是一个比单纯跑各种Benchmark来得更有价值的事情。

    将Folding@home程序目录复制7份,各自分配不同的机器号并指定不同的GPU,这样7个蛋白质程序就能互不干涉的各自独立运行,由于7个程序全靠GPU运算,因此CPU占用率非常低,完全不会影响普通2D软件的运行。

    运行几个小时之后,性能估值已经出来了,7块显卡的PPD分值(Points Per Day每日运算得分)都是7000多,总分值高达53K,已经和国内第一强人65K的成绩相差不远了。

    通过内置的Benchmark测试来看,每片GTX260+都能够达到7K左右的PPD,七卡插一起的性能和单卡相比基本没有损失,但由于网络不稳的关系,长时间运行的话,个别数据包算出来的平均PPD会有所下降。

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